Pokud jedinec podstoupí změnu svého pohlaví, nepovede to ke změně jeho pohlaví v očích církve.
Po ročním studiu Vatikán roku 2000 rozeslal tajný dokument vybraným církevním zástupcům do všech zemí a teprve nyní, kdy se ukázalo, že spousta biskupů nemá o jeho existenci tušení, byl rozeslán předsedům biskupských konferencí jednotlivých zemí.
Podle zdroje agentury Catholic News Service obeznámeného s jeho obsahem si církev myslí, že "chirurgická změna pohlaví je natolik povrchní a vnější záležitostí, že nemění samu osobnost. Osoba tak je i nadále mužem nebo ženou podle toho, jak tomu bylo před operací."
Dokument také nařizuje biskupům, aby v takovém případě nikdy neměnili pohlaví osob zapsané v církevních matrikách. Katolíci, kteří podstoupí změnu pohlaví, nemohou uzavřít církevní sňatek, nesmějí být vysvěceni na kněze ani se nesmějí účastnit řeholního života.